Если вы занимаетесь предпринимательством в Эстонии, вам надо платить налоги в соответствии с действующими в Эстонии налоговыми законами. Налогом облагаются имущество, доходы и выгоды. Общее правило заключается в том, что все предприятия облагаются в равной степени и на тех же правовых основаниях.

Основные налоги в Эстонии
Какие налоги платить, и по какой ставке, зависит от особенностей вашего предприятия.

Подоходный налог
Есть два вида подоходного налога – подоходный налог физических лиц и подоходный налог юридических лиц (подоходный налог юридических лиц платят также нерезиденты, имеющие постоянное место деятельности).

Налогообложение дохода юридического лица
Особенностью подходного налога юридических лиц в Эстонии является то, что налогом облагается только распределенная прибыль. Если прибыль реинвестируется в предприятие, она не облагается налогом. Подоходный налог нужно платить с распределенной прибыли, с расходов и выплат, не связанных с предпринимательством, с подарков и пожертвований, с представительских расходов и особых льгот, предоставленных работникам.
Налогообложение зарплат работников
Доход физических лиц также облагается подоходным налогом, и при осуществлении выплаты необходимо удержать подоходный налог с брутто-зарплаты работника. Необлагаемый налогом минимум составляет 144 евро в месяц. Вдобавок к подоходному налогу из зарплаты работника нужно удержать также взнос в обязательную накопительную пенсию 2% и взнос в кассу страхования от безработицы 2%. Также работодатель платит с брутто-зарплаты работника социальный налог 33% и взнос работодателя в кассу страхования от безработицы 1%.
Размер подоходного налога и сроки уплаты
Ставка подоходного налога юридического лица в 2013 и 2014 году 21/79 (21%). Ставка подоходного налога физического лица в 2013 и 2014 году 21%. Периодом налогообложения является календарный месяц. Декларацию необходимо подавать к 10-му числу следующего месяца.
Дивиденды
0% в случае если:
— дивиденды получены от дочерних компаний из договорного государства или Швейцарии,
— дочерняя компания является налогоплательщиком (ставка не менее, чем 1/3 от действующей в Эстонии);
— дивиденды получены из других стран, если с дохода, послужившего основанием для выплаты, подоходный налог был уплачен, или с выплаченных дивидендов налог удержан.
Налог на прирост капитала
21% для физических лиц – резидентов Эстонии;
0% для компаний — резидентов Эстонии;
21%  для нерезидентов Эстонии, в случае, если доход получен от продажи недвижимости или доли в компании (10% и более), более 50% имущества которой составляет недвижимость в Эстонии;
Удерживаемые налоги при выплатах нерезидентам:
Дивиденды  — 0%;
Проценты – 21% с разницы между выплаченной ставкой и рыночной ставкой (с 2014 года только при сделках между связанными лицами);
Роялти – 10%;
NB! Может применяться пониженная ставка либо освобождение  при наличии соответствующего международного соглашения либо в соответствии с соответствующими директивами ЕС (Interest & Royalty Payment Directive).

Налог на добавленную стоимость (НДС)
Налогом на добавленную стоимость облагаются продаваемые в ходе предпринимательской деятельности товары и оказываемые услуги, импорт товара из стран, находящихся за пределами Европейского Союза, и приобретение товара из стран-членов Европейского Союза.
Регистрация плательщиком НДС
Если годовой налогооблагаемый оборот вашей компании превысил 16 000 евро, компанию нужно зарегистрировать плательщиком НДС в Налогово-Таможенном департаменте. Если оборот меньше, регистрация не обязательна, но возможна.
Ставки НДС
Стандартная ставка НДС в Эстонии 20%.
Для части товаров и услуг действует ставка 9%, например, для книг, школьных тетрадей, периодичных изданий, услуг размещения и определенных лекарств.
Ставка НДС 0% действует в отношении некоторых товаров, в том числе для товаров, экспортируемых из ЕС, и товаров, продаваемых плательщику НДС из другой страны-члена ЕС. Услуги, оказываемые за пределами Эстонии, некоторые услуги, связанные с водным и воздушным транспортом, и услуги транспортировки товара за пределами Эстонии тоже облагаются по ставке 0%.
Декларирование и уплата НДС
Периодом налогообложения является календарный месяц. Налоговую декларацию нужно представить и налог нужно заплатить к 20-му числу следующего месяца.

Налоги при трансграничных сделках
Если вы заключаете трансграничные сделки, то возможно часть налогов, связанных со сделками или заработной платой, надо будет уплачивать в иностранном государстве. Налоговые законы в разных странах различаются, поэтому перед заключением сделки надо обязательно познакомиться с местным законодательством.

Подоходный налог
У компании возникает обязанность уплаты подходного налога в иностранном государстве в следующих случаях:
если компания предлагает услуги или продает товар, доход с который облагается налогом в стране, в которой осуществлялись сделки;
если деятельность компании такова, что в иностранном государстве возникает постоянное место деятельности. Постоянным местом деятельности является место, посредством которого полностью или частично происходит хозяйственная деятельность компании.
С продажи каких товаров или услуг, и в каких случаях нужно платить подоходный налог в иностранном государстве, необходимо уточнить заранее.
Эстония заключила договоры об избежании двойного налогообложения и предотвращении уклонения от налогов www.emta.ee/index.php?id=1830 со многими государствами. Согласно этих договоров обязанность уплаты подоходного налога с доходов от предпринимательства в другой стране возникает только, если там возникло постоянное место деятельности. Для получения налоговой льготы эстонская компания должна доказать, что она является резидентом Эстонии. Справку о резидентности выдает Налогово-Таможенный департамент, но нужно принимать во внимание, что есть государства, установившие особые регуляции, и одной справки о резидентности может быть не достаточно.

Подоходный налог работников, работающих за пределами Эстонии
Уплата подоходного налога при работе зарубежом зависит от трудового договора, специфики деятельности компании и от того, возникает ли у компании постоянное место деятельности зарубежом. Если работник пребывает в другом государстве более 183 дней в течение последовательных 12 календарных месяцев, он должен с полученного дохода уплатить подоходный налог в стране пребывания.

Социальный налог
Обычно при уплате социального налога исходят из принципа, что государство, в котором работает работник, отвечает за медицинское и пенсионное страхование. Если работник вашей эстонской компании постоянно работает в иностранном государстве, социальный налог тоже нужно платить в иностранном государстве. Если же работник компании находится в зарубежной командировке, социальный налог платится в Эстонии, а у работника должна быть соответствующая справка. При ее отсутствии может возникнуть ситуация, что социальный налог нужно будет заплатить в стране командирования. Если же работник одновременно работает в нескольких государствах, в отношении него в части социального налога действует законодательство той страны, где он живет.

Налог на добавленную стоимость
Обложение налогом на добавленную стоимость происходит в стране, где возникает оборот товаров или услуг. Как правило, услуги облагаются в стране нахождения получателя, если получателем является плательщик НДС из другой страны ЕС или предприниматель из несоюзного государства. Таким образом, получатель услуги платит НДС в своей стране, т.е. к услуге применяется обратное налогообложение. Однако, в известных случаях, например, услуги, связанные с недвижимостью, место возникновения оборота определяется по месту физического оказания услуги.