Согласно действующей конституции, принятой в 1992 году, Эстония является независимой демократической парламентской республикой, в которой высшим носителем власти является народ.
Законодательная власть принадлежит Рийгикогу (эст. Riigikogu) — однопалатному парламенту, в состав которого входит 101 депутат, избираемый по пропорциональной системе в ходе равных и прямых выборов. В выборах парламента, избираемого на 4 года, имеют право участвовать все достигшие 18 лет дееспособные граждане Эстонской Республики. Последние парламентские выборы состоялись в марте 2011 года.
Главой государства является Президент Республики, избираемый на 5 лет, но не более чем на два срока подряд, депутатами Рийгикогу (парламента) или коллегией выборщиков в ходе тайного голосования. Коллегия выборщиков состоит из депутатов парламента и делегатов от всех советов местных самоуправлений и созывается в случае, когда ни одному из кандидатов в президенты не удалось набрать требуемого большинства голосов в парламенте (две трети от конституционного состава). В коллегии выборщиков для избрания главы государства достаточно простого большинства. Каждый член Рийгикогу или коллегии выборщиков имеет один голос.
Исполнительная власть принадлежит Правительству Республики. Правительство возглавляет премьер-министр, которым является лидер победившей на выборах в парламент партии, либо лидер парламентской коалиции. Кабинет министров утверждается президентом по представлению кандидата в премьер-министры, получившего одобрение парламента.
Высшая судебная инстанция — Государственный суд (Riigikohus), суды апелляционной инстанции — окружные суды (Ringkonnakohus), суды первой инстанции — земельные суды (Maakohus), органы прокуратуры — Государственная прокуратура (Riigiprokuratuur), окружные прокуратуры (ringkonnaprokuratuur).
Все вопросы местной жизни решаются местными самоуправлениями, которые действуют в пределах закона автономно, имеют собственный бюджет и право устанавливать некоторые местные налоги и сборы. Основным органом местного самоуправления является совет (эст. volikogu), избираемый на четырёхлетний срок постоянными жителями данного муниципалитета (в отличие от парламентских выборов, на местных выборах могут голосовать также и лица без гражданства и граждане других стран имеющие статус постоянного жителя).